MBFB技術應用于水產養殖原水處理系統中，原水中農藥、除草劑、殺菌消毒劑等小分子有機物與在曝氣條件下與處于流化狀態的活性炭粉末進行傳質、混合，被吸附、富集在活性炭表面，使活性炭表面形成局部污染物濃縮區域；粉末活性炭同時也為微生物繁殖提供了特殊的表面，其多孔的表面吸附了大量微生物菌群，在高溶解氧條件下，微生物對富集在活性炭表面局部濃縮的農藥、除草劑、殺菌消毒劑等小分子有機物進行氧化分解，然后利用分體膜分離系統將水和吸附了有機物的粉末活性炭等懸浮顆粒分開，通過錯流過濾制取不含或少含農藥、除草劑、殺菌消毒劑等小分子有機物原水。
好的水產養殖方式是實現循環水養殖，傳統的流水養殖模式對水源依賴十分嚴重，一旦水源污染，養殖就面臨巨大風險。而實現其循環水養殖改變這一現狀的核心技術就是MBFB工藝。
膜生物流化床以生物流化床為基礎，以粉末活性炭等介質為載體，結合無機陶瓷膜固液分離技術，是普通活性污泥法和生物膜法相結合的廢水生化處理技術。生物流化床反應器集載體的物理吸附、微生物降解和膜的高效分離作用為一體，使有機物和載體曝氣條件下充分地傳質、混合，載體對有機物、微生物和溶解氧進行吸附、富集、水解、氧化分解，后利用陶瓷膜分離系統將水和吸附了有機物的載體等懸浮顆粒分開，通過錯流過濾，進一步凈化污水，使其達到中水回用標準，研究表明，MBFB能有效除去微污染水體中氨氮、COD和其它難降解小分子有毒有機物等。
循環水處理工藝：
海水養殖循環水處理采用AFF-引氣氣浮-MBFB-紫外消毒工藝，其中AFF直接濾除原水中直徑大于5微米的懸浮物；MBFB也是一種高效生物反應器，其生化處理效率是普通生物過濾的20倍，能有效除去水體中有機物和氨氮、亞硝酸鹽等有毒化合物；消毒主要采用紫外消毒或光催化消毒工藝，消毒效率高，無藥物殘留。淡水養殖循環水處理工藝和海水大同小異，只是沒有氣浮工段。
